Структура МГТУ им. Н.Э. Баумана включает следующие основные элементы:

• Ректорат. 1 Адрес: ул. 2-я Бауманская, д. 5, к. 1, Главный корпус. 1
• Научно-учебные комплексы: 1
• «Радиоэлектроника, лазерная и медицинская техника» (ул. 2-я Бауманская, д. 5, к. 1, Главный корпус); 1
• «Фундаментальные науки» (Рубцовская наб., д. 2/18, УЛК); 1
• «Энергомашиностроение» (Лефортовская наб., д. 1, Корпус Э); 1
• «Специальное машиностроение» (Госпитальный пер., д. 10). 1
• Студенческий научно-технический центр. 1
• Управление капитального строительства (УКС). 1
• Управление по техническому регулированию и обеспечению единства измерений. 1
• Центр креативных индустрий (Креатив-центр). 1
• Управление «Приёмная комиссия». 1
• Центр дополнительного образования. 1

Также в структуру университета входят учебные, научно-образовательные и научно-исследовательские центры: 1

• Учебно-научный молодёжный космический центр МГТУ им. Н.Э. Баумана (Госпитальный пер., д. 10, Корпус СМ); 1
• Научно-образовательный центр «Дизайн-центр оптоэлектроники и фотоники» (ул. 2-я Бауманская, д. 5, к. 1, Главный корпус); 1
• Научно-образовательный центр «Дизайн и разработка продуктов и технологий» (ул. 2-я Бауманская, д. 5, к. 1, Главный корпус); 1
• Научно-образовательный центр «Передовые информационные технологии и критическая информационная инфраструктура» (ул. 2-я Бауманская, д. 5, к. 1, Главный корпус); 1
• Научно-образовательный центр «Данные без границ» (ул. 2-я Бауманская, д. 5, к. 1, Главный корпус). 1

Кроме того, у МГТУ им. Н.Э. Баумана есть два филиала: Мытищинский и Дмитровский. 25