Трипаносомы паразитируют на позвоночных хозяевах в крови, лимфе, во внутренних органах, межклеточном пространстве, на слизистой оболочке мочеполовых органов. 2 В кишечнике переносчика трипаносомы размножаются в критидиальной форме, после чего образуются трипаносомные формы, заразные для позвоночного. 1 В крови заражённого хозяина обнаруживаются трипаносомные формы паразита. 1 Для части видов рода (секция Salivaria) трипаносомная форма является единственной при размножении паразита в позвоночном хозяине. 1 У других видов (секция Stercoraria) паразит у позвоночного размножается в лейшманиальной или критидиальной форме. 1

На беспозвоночных хозяевах, в основном членистоногих, трипаносомы паразитируют в кишечнике. 1 Например, в кишечнике кровососущих комаров встречаются L. anophelini и Н. culicis, а у москитов — Н. phlebotomi. 1 Для закрепления на кутикуле трипаносомы используют механизм, при котором их жгутики трансформируются в присосковидную структуру. 4