Транскрипционные факторы влияют на экспрессию генов в эукариотических клетках, обеспечивая снижение (репрессоры) или повышение (активаторы) константы связывания РНК-полимеразы с регуляторными последовательностями регулируемого гена. 4

Эти факторы обычно имеют ДНК-связывающие домены, которые связывают специфические элементы последовательности основного промотора и помогают рекрутировать РНК-полимеразу в сайт начала транскрипции. 1

Некоторые механизмы влияния транскрипционных факторов на экспрессию генов:

• Трансформация гетерохроматина. 3 Чтобы регуляторные белки могли связаться с ДНК, гетерохроматин должен быть трансформирован в эухроматин, обычно путём модификаций гистонов. 3
• Влияние на характер упаковки хроматиновой фибриллы. 3 Модификации гистонов влияют на характер упаковки хроматиновой фибриллы, разрыхляя или, наоборот, уплотняя её, что облегчает или затрудняет доступ к ДНК регуляторным факторам. 3
• Действие коактиваторов. 3 Коактиватор увеличивает экспрессию генов путём связывания с активатором (или фактором транскрипции), который содержит ДНК-связывающий домен. 3

Помимо транскрипционных факторов, необходимых для экспрессии всех генов, существуют также специфичные факторы транскрипции, обеспечивающие включение/выключение определённых генов в нужный момент. 3