Трансдукция используется для генетических исследований и картирования бактериальных геномов путём определения группы сцепления и положения картируемого гена относительно других генов данной хромосомы. 4

Метод основан на том, что фрагменты бактериальной ДНК, переносимые при трансдукции, достаточно велики и могут содержать целый ряд генов. 2 Поэтому близко расположенные гены могут при трансдукции переноситься одновременно (котрансдукция). 2 Чем меньше гены сцеплены, тем меньше наблюдается котрансдукция. 2 На основе этой информации можно восстановить порядок следования генов на бактериальной хромосоме. 2

Также трансдукция используется для переноса генов в другие клетки и получения делеций в хромосомах бактерий. 4