Как топологические домены влияют на функционирование генома?

Топологические домены влияют на функционирование генома несколькими способами:

• Обеспечивают избирательность промотор-энхансерных взаимодействий. 2 Это проявляется в скоординированном и синхронном изменении активности генов в пределах одного домена. 2
• Препятствуют распространению хроматиновых модификаций. 2 Границы соседних топологических доменов ограничивают физическое взаимодействие между регуляторными элементами из разных доменов. 2
• Влияют на укладку хромосом. 1 Например, хромосомы с большим числом ламиноассоциированных доменов обычно располагаются на периферии ядра, а меньшие хромосомы чаще занимают центральные положения, так как содержат больше активных генов. 1
• Способствуют функционированию геномных кластеров, для которых необходима ко-регуляция. 2 Например, в индивидуальные домены организованы гены цитохромов, обонятельных рецепторов и прото-кадгерина. 2

Однако некоторые исследования показывают, что эффект от нарушения структуры топологических доменов на экспрессию генов зависит от эпигенетического контекста и иногда является незначительным. 2