Теория нейтральной эволюции объясняет процессы молекулярной эволюции живых организмов тем, что подавляющее число мутаций на молекулярном уровне носит нейтральный по отношению к естественному отбору характер. 5
Как следствие, значительная часть внутривидовой изменчивости, особенно в малых популяциях, объясняется не действием отбора, а случайным дрейфом мутантных аллелей, которые нейтральны или почти нейтральны. 25
Нейтральная теория допускает возможность того, что большинство мутаций являются вредными, но утверждает, что, поскольку они быстро устраняются естественным отбором, они не вносят существенного вклада в вариации внутри видов и между ними на молекулярном уровне. 4
При этом теория нейтральной эволюции не оспаривает решающей роли естественного отбора в развитии жизни на Земле, она лишь объясняет механизмы, проходящие на клеточном, надклеточном и органном уровнях. 1