Теория функций в биологии, в частности эволюционная физиология, помогает изучать эволюционные процессы, так как исследует формирование и изменение функций организма в зависимости от внутренних и внешних факторов. 15

Некоторые аспекты влияния теории функций на изучение эволюции:

• Выявление закономерностей. 1 Эволюционное направление в физиологии позволило установить новые закономерности в функциональной эволюции мозга и различных систем организма, выявить общие принципы эволюции структуры и функции органов чувств, эволюции двигательной системы и других процессов. 1
• Объяснение возникновения новых органов и функций. 2 Например, второстепенная функция, которая не влияла на морфологию предковой структуры, у потомков в ходе эволюции может стать главной, вызвав соответствующие морфологические изменения органа. 2
• Раскрытие сущности функциональной эволюции. 15 Эволюционная физиология объясняет, почему формирование и развитие новых функциональных отношений происходило именно так, а не иначе. 15