Технологии генной инженерии применяются в создании трансгенных организмов следующим образом: 3

1. Получение изолированного гена. 23 Синтез, выделение и идентификация целевых фрагментов ДНК или РНК и регуляторных элементов. 3
2. Введение гена в вектор для встраивания в организм. 3 Создание в пробирке генетической конструкции (трансгена), которая содержит один или несколько фрагментов ДНК в совокупности с регуляторными элементами. 3
3. Перенос вектора с конструкцией в модифицируемый организм-рецепиент. 3 Как правило, в качестве вектора используют плазмиды — небольшие кольцевые молекулы ДНК бактериального происхождения. 3
4. Молекулярное клонирование. 3 Если модификации подвергаются одноклеточные организмы или культуры клеток многоклеточных, то на этом этапе начинается клонирование, то есть отбор тех организмов и их потомков (клонов), которые подверглись модификации. 2 Когда поставлена задача получить многоклеточные организмы, то клетки с изменённым генотипом используют для вегетативного размножения растений или вводят в бластоцисты суррогатной матери, когда речь идёт о животных. 2
5. Отбор генетически модифицированных организмов. 2 Устранение тех, которые не были успешно модифицированы. 2

Основой для появления у организма нового признака служит биосинтез новых для организма белков — продуктов трансгена, например, у растений — устойчивости к засухе или насекомым-вредителям. 3