Харон оказывает сильное гравитационное влияние на Плутон, оттягивая его «от центра». 25 Из-за этого оба объекта вращаются вокруг воображаемой точки над поверхностью Плутона, а не внутри него. 25 Эта точка называется центром тяжести системы Плутон-Харон. 25

Кроме того, Харон защищает атмосферу Плутона от воздействия солнечного ветра. 1 Спутник может менять направление солнечного ветра, предотвращая столкновение сильно ионизированных частиц с молекулами газа в атмосфере Плутона. 1

Мощнее всего этот эффект проявляется, когда Харон находится между Солнцем и Плутоном, а слабее всего — когда он позади карликовой планеты. 1