Некоторые современные методы визуализации, которые помогают изучать взаимодействие рибосом с мембранными структурами:
- Криоэлектронная томография. www.fbras.ru Применяется в сочетании с субтомографическим анализом, который позволяет извлекать из томограмм информацию о локализации и ориентации рибосом. www.fbras.ru С помощью этого метода можно определить топологию мРНК в циркулярных, двурядных и спиральных полирибосомах и описать детали взаимодействия между рибосомами в полисомах. www.fbras.ru
- Моделирование молекулярной динамики. istina.msu.ru Позволяет наблюдать с атомным разрешением изменение конформации и относительного расположения мономерных звеньев белков и нуклеиновых кислот во времени, оценивать силу взаимодействий между этими звеньями, описывать их взаимодействие с молекулами. istina.msu.ru
Также для исследования рибосом используется метод совмещения со стандартной структурой. www.fbras.ru Он находит соответствие между известной структурой рибосомы и плотностью рибосомы в томограмме. www.fbras.ru
Кроме того, для визуализации и анализа молекулярных структур применяется программное обеспечение, например ChimeraX. kpfu.ru