Современные методы молекулярной генетики влияют на изучение центров происхождения растений следующим образом:

• Позволяют вести исследования на разных уровнях. 4 От отдельных популяций видов вплоть до самых высоких таксономических категорий. 4
• Помогают выяснить родство между близкородственными таксонами и изучить внутривидовое разнообразие. 4 Для этого используются методы, основанные на изучении анонимного полиморфизма ДНК (RAPD, ISSR, АFLP, DAF, метод микросателлитов и другие). 4
• Используются для анализа родственных отношений более высоких таксономических категорий (род, семейство, класс). 4 Для этого применяют методы сравнения последовательностей ДНК определённых фрагментов, например секвенирование участков ДНК. 4

Кроме того, молекулярно-генетические методы позволяют анализировать транскрипционную активность генов, получать новые данные об эволюции генома и составлять представление о молекулярно-генетических механизмах, лежащих в основе наследования и формирования полезных признаков у растений. 2