Криоэлектронная микроскопия позволяет визуализировать динамику рибосом во время трансляции с разрешением, близким к атомному. 3 С помощью этого метода учёные получают серию трёхмерных «снимков», которые показывают рибосому на разных стадиях процесса. 4
Некоторые результаты исследований с применением криоэлектронной микроскопии:
- Понимание структурной сложности. 4 Метод помог отобразить положения связывания критических лигандов, таких как тРНК и коэффициенты удлинения Tu (EF-Tu) и G (EF-G). 4
- Изучение действия антибиотиков. 5 Структурные исследования с применением криоэлектронной микроскопии позволили продвинуться в понимании того, как те или иные антибиотики действуют на рибосомы, как они ингибируют индивидуальные реакции, в каких сайтах они связываются. 5
Молекулярное моделирование позволяет исследовать различные аспекты функционирования рибосомы. 1 Некоторые возможности метода:
- Моделирование структур. 1 Можно изучать состояния рибосомы, которые едва ли обнаружимы экспериментально, и оценивать их энергетические характеристики. 1
- Исследование физико-химических характеристик. 1 Метод помогает изучать стенки рибосомного туннеля или упорядоченность воды в нём. 1
- Моделирование сложных движений. 1 Можно исследовать согласованные движения и конформационные перестройки в структуре рибосомы, которые происходят при её функционировании или возбуждаются связыванием антибиотиков. 1
Таким образом, сочетание криоэлектронной микроскопии и молекулярного моделирования позволяет получать более глубокие знания о структуре и работе рибосом.