Соматическая гибридизация растений позволяет расширить генетическое разнообразие следующим образом: она объединяет геномы видов, никогда не скрещивающихся в природе. 3 Это происходит благодаря тому, что для слияния протопластов не существует барьеров, поэтому на уровне протопластов могут быть объединены несовместимые при половом размножении виды растений. 2

Кроме того, соматическая гибридизация:

• Позволяет обойти проблему половой несовместимости у растений. 2
• Облегчает перенос между разными видами внеядерных генетических элементов (митохондриальных и хлоропластных ДНК). 2
• Обеспечивает возможность получения необычных сочетаний ядерных и цитоплазматических генов. 2