Синергия в естественных науках проявляется, например, в согласованном, когерентном действии двух разных видов или потоков энергии, принадлежащих разным источникам. 4 В таких теориях, как теория лазерного излучения (Г. Хакен) и теория диссипативных структур (И. Пригожин), синергия — это взаимодействие внутренней и внешней энергий, порождение новых форм, полей, структур. 4

Также в естественных науках существует биохимическая синергия, на основе которой строятся многоступенчатые системы медикаментозного лечения, когда несколько препаратов в комбинации усиливают друг друга. 3 Например, как снимающие спазм препараты и обезболивающие. 3

Ещё одно проявление синергии в естественных науках — эффективное производство новых знаний в рамках временных рабочих групп, когда участники взаимодействуют на равных и совместно обсуждают варианты стоящих задач. 1