Саркожгутиковые приспосабливаются к изменениям окружающей среды и условиям выживания следующим образом:

• Образуют цисты. 12 При наступлении неблагоприятных условий окружающей среды саркожгутиковые перестают питаться, их тело становится округлым и приобретает плотную оболочку (цисту). 1 В таком состоянии они могут перенести пересыхание водоёма и низкую температуру. 1
• Меняют характер питания. 2 Например, эвглена способна менять характер питания в зависимости от условий среды. 2 На свету ей свойственно автотрофное питание — способность самостоятельно синтезировать органические вещества из неорганических. 2 В темноте эвглена питается гетеротрофно — получает готовые органические вещества с пищей. 2
• Дышат всей поверхностью тела. 13 Газообмен происходит с растворённым в воде кислородом, который проникает в клетку. 2