Некоторые отличия регуляции генов у эукариот и прокариот:

• У прокариот регуляция осуществляется на уровне оперона. 3 Процессы транскрипции и трансляции сопряжены: в процессе транскрипции образуется зрелая мРНК, которая сразу же может быть использована для трансляции. 5
• У эукариот процессы транскрипции и трансляции пространственно разделены — они происходят в ядре и цитозоле соответственно. 3
• Почти всегда оперон эукариот содержит только один структурный ген, в то время как у вирусов и прокариот в большинстве оперонов их бывает несколько, иногда более десятка. 2
• У эукариот структурные гены, ответственные за разные звенья той или иной цепи биохимических реакций, как правило, разбросаны по геному, а не сосредоточены в одном опероне, как это часто имеет место у прокариотов. 2
• У эукариот существует одновременное групповое подавление активности генов во всём ядре, в целой хромосоме, или в большом её участке. 2
• У эукариот развита регуляция экспрессии на уровне стабильности (времени жизни), трансляционной активности, локализации мРНК. 4