Промежуточный мозг образуется в процессе эмбрионального развития из задней части зародышевого переднего мозга. 5

Некоторые этапы эволюции промежуточного мозга у позвоночных животных:

• Низшие позвоночные (рыбы и земноводные). 2 Для них характерно преобладание среднего мозга над остальными отделами. 2 Только у хрящевых акуловых рыб в связи с быстрым движением развит мозжечок, а сильно развитое обоняние привело к увеличению переднего мозга, который становится центром переработки обонятельных сигналов. 2
• Земноводные. 2 У них несколько увеличивается передний мозг и в крыше полушарий образуется тонкий слой нервных клеток — первичный мозговой свод (архипаллиум), древняя кора. 2 Помимо архипаллиума, у земноводных усиливаются связи переднего и среднего мозга. 2
• Рептилии. 2 У них значительно увеличивается передний мозг за счёт скоплений нервных клеток — полосатых тел — на дне переднего мозга. 2 Большую часть крыши полушарий занимает древняя кора. 2 Впервые у рептилий появляется зачаток новой коры — неопаллиум. 2 Полушария переднего мозга наползают на другие отделы, вследствие чего образуется изгиб в области промежуточного мозга. 2
• Млекопитающие. 2 У них передний мозг достигает наибольшей величины и сложности. 2 Большую часть мозгового вещества составляет новая кора — вторичный мозговой свод, или неопаллиум. 2 Он состоит из нервных клеток и волокон, расположенных в несколько слоёв. 2 Новая кора больших полушарий служит центром высшей нервной деятельности. 2 Промежуточный и средний отделы мозга у млекопитающих невелики. 2 Разрастающиеся полушария переднего мозга накрывают их и подминают под себя. 2