Молекулярная идентификация растений в ботанике развивается благодаря совершенствованию современных технологий и росту знаний об отдельных генах и геномах растений. 4

Молекулярные методы основаны на применении ДНК-маркеров и позволяют: 1

• в большей степени выявить объективные различия между исследуемыми образцами и повысить разрешающую способность анализа; 1
• применять методы на любых стадиях развития растений, начиная с семян; 1
• исследовать разные части растения, например, клубни, листья, стебли или другие органы; 1
• использовать в спорных случаях, когда применение традиционных подходов не позволяет достоверно различить исследуемые образцы. 1

Для видоидентификации дикорастущих растений эффективен метод секвенирования вариабельных таксономически значимых фрагментов ДНК. 4 Для этого чаще всего применяют хлоропластные маркеры и ядерные маркеры ITS1 и ITS2. 4

Также в этой области революцию произвела разработка методов секвенирования следующего поколения (NGS). 5 Они позволили быстро накапливать эталонные последовательности хлоропластов, митохондрий и генома, а также проводить высокопроизводительное секвенирование и видовую идентификацию многокомпонентных растительных продуктов или композиций. 5