Трёхдоменная система Карла Вёзе, предложенная в 1977 году, изменила классификацию живых организмов, заменив дихотомическую картину (эукариоты / прокариоты) на трёхветвистую (эубактерии / археи / эукариоты). 4

Некоторые аспекты влияния трёхдоменной системы на классификацию:

• Введение нового уровня классификации. 25 Трёхдоменная система добавляет уровни (домены) «выше» царств, которые были приняты в ранее использовавшихся системах с пятью или шестью царствами. 25
• Признание фундаментального различия между двумя группами прокариот. 25 Классификация считает архей более близкими эукариотам, чем бактериям. 25
• Новое понимание путей эволюционного развития. 4 Вёзе утверждал, что бактерии, археи и эукариоты произошли отдельно от предка со слабо развитым генетическим аппаратом. 5
• Возможность идентификации микроорганизмов. 4 Работы Вёзе породили новое направление — использование секвенирования для изучения природных микробных популяций, что позволило идентифицировать микроорганизмы в любых местах обитания. 4