Разные виды эпистаза влияют на проявление генов по-разному, в зависимости от того, доминантным или рецессивным является ген-ингибитор. 2
Доминантный эпистаз предполагает, что доминантный аллель одного гена подавляет действие аллельной пары другого гена. 3 Например, доминантный ген одной аллельной пары обусловливает вороную (чёрную) масть лошади, а рецессивный ген — рыжую. 2 Эти гены могут проявиться фенотипически только при отсутствии в генотипе лошади доминантного гена другой аллели — ингибитора. 2 При наличии ингибитора проявление генов вороной и рыжей масти подавляется. 2
Рецессивный эпистаз (криптомерия) проявляется в том, что рецессивные аллели одного гена в гомозиготном состоянии подавляют действие доминантного аллеля другого гена. 3 Например, при наследовании цвета семян фасоли проявление рецессивного ингибитора ведёт к блокировке действия генов красной и жёлто-коричневой окраски, и семена оказываются белыми. 2
Также существует двойной рецессивный эпистаз, при котором две рецессивные аллели одного гена подавляют другой ген, но и две рецессивные аллели второго гена подавляют первый ген. 5
Эпистатическое взаимодействие генов приводит к различным отклонениям от классического расщепления фенотипов 9 : 3 : 3 : 1 при дигибридном скрещивании. 5