Размер полипептида может влиять на его функциональность, например, определять растворимость пептида. 3 Растворимость зависит от размера молекулы и от химической природы входящих в неё аминокислотных остатков. 3

Также изменение длины аминокислотной последовательности помогает определить расположение активных центров пептида и участка рецепторного взаимодействия. 5

Кроме того, замена одной аминокислоты в структуре пептида способна в несколько раз увеличить его биологическую активность или изменить её направленность. 5

Таким образом, размер полипептида и его структура взаимосвязаны и влияют на функциональность молекулы.