Семязачатки различаются по строению и происхождению следующим образом:

По строению выделяют основные морфологические типы семязачатка: 1

• Ортотропный (прямой). 15 Например, в семействах перцевые, гречишные. 1
• Анатропный (обращённый). 13 Распространён у покрытосеменных. 3
• Гемитропный (полуобращённый). 3 Например, у губоцветных, паслёновых. 3
• Кампилотропный (односторонне изогнутый). 13 Например, у гвоздичных, гераниевых. 3
• Амфитропный (двусторонне изогнутый). 3 Например, у бобовых, крестоцветных, частуховых. 3

По числу интегументов различают семязачатки с одним (многие двудольные и некоторые однодольные растения), двумя (большинство однодольных и многие двудольные), иногда с тремя интегументами (семейство аноновые), редко — без них. 1

Интегументы отличаются по происхождению, числу слоёв и длине. 1

Также семязачатки различны по типу халазы, наличию проводящего пучка, строению микропиле и фуникулуса. 1 Последний может быть хорошо выраженным (различной длины и конфигурации) или отсутствовать. 1

По происхождению интегументы могут быть из клеток плаценты мегаспорофилла (плодолистика) или закладываться в виде кольцевого валика в основании нуцеллуса и обрастать его, оставляя над вершиной узкий канал — микропиле (пыльцевход). 5