Подвиды жёлтой трясогузки различаются рисунком головы. 12 Например, у подвида M. f. lutea, обитающего в Поволжье и Юго-Западной Сибири, на голове имеется бледная серовато-жёлтая шапочка, тогда как у подвида M. f. feldegg она почти чёрная. 1
Также у разных подвидов могут отличаться подбородок и передняя часть шеи: они могут быть как ярко-жёлтого, так и белого цвета. 1
Ещё один признак, по которому различаются подвиды, — окраска спины: у всех подвидов она оливково-зелёная, как у самцов, так и у самок. 2
Кроме того, у некоторых подвидов могут быть различия в размерах: например, в европейской части России широко распространена раса М. f. flava, которая отличается относительно крупными размерами, наличием белой брови и светлыми пятнышками под глазом. 4 На юге Западной Сибири и в Казахстане обитает более мелкий подвид М. f. beema, который отличается также более широкой бровью, белой окраской нижней части кроющих перьев уха, а также немного более светло-серой окраской головы. 4