Разделение популяций может повлиять на их генетическую структуру следующим образом:

• Каждая популяция будет эволюционировать независимо. 3 Мутации, возникающие в одной популяции, не смогут проникнуть в другую. 3
• В разных популяциях зафиксируются разные наборы аллелей. 3 Это происходит из-за дрейфа генов. 3
• Естественный отбор перестроит генетическую структуру каждой изолированной популяции на свой лад, приспосабливая её к локальным условиям. 3

Кроме того, при разделении популяций может снизиться гетерозиготность. 2 Аллели имеют более высокие шансы достичь фиксации в субпопуляциях, особенно если они малочисленны или находились в изоляции в течение длительного периода времени. 2