Распространение хантавирусов в глобальном масштабе, вероятно, эволюционировало благодаря параллельному развитию вирусов и их хозяев — грызунов. 4 Каждый вид грызунов является носителем определённого вируса. 4
Современное разнообразие хантавирусов, по некоторым предположениям, возникло в результате множественных миграций хозяина — рыжей полевки — после ледникового периода. 2 Некоторые филогенетические линии, вероятно, имели общего предка, например, русские, латвийские и финские. 2
Типичные хантавирусы Старого Света (вирус Хантаан, сеульский вирус, вирус Добрава-Белград и вирус Пуумала) наиболее распространены в Европе и Азии, а типичные хантавирусы Нового Света (вирус Син Номбре и вирус Анд) — в Северной и Южной Америке. 1
При этом на африканском континенте, несмотря на серологические исследования, не было выделено ни одного хантавируса, что удивительно, учитывая, что этот континент отличается наибольшим разнообразием видов грызунов. 4