Как работает вторичная структура в транспортных матричных РНК?

Вторичная структура в транспортных РНК (тРНК) работает следующим образом: она формируется за счёт образования максимального числа водородных связей между внутримолекулярными комплементарными парами азотистых оснований. kpfu.ru В результате образуются биспиральные ветви, заканчивающихся петлями из неспаренных нуклеотидов. kpfu.ru

Пространственное изображение вторичных структур всех тРНК имеет форму клеверного листа. kpfu.ru В нём различают четыре обязательные ветви, некоторые тРНК, кроме того, содержат короткую пятую (дополнительную) ветвь. kpfu.ru

Некоторые элементы вторичной структуры и их функции:

• Акцепторная ветвь. kpfu.ru К 3'-концу присоединяется эфирной связью аминокислотный остаток. kpfu.ru
• Антикодоновая ветвь. kpfu.ru На вершине находится петля, содержащая антикодон. kpfu.ru Антикодон представляет собой специфический триплет нуклеотидов, который комплементарен в антипараллельном направлении кодону мРНК, кодирующему соответствующую аминокислоту. kpfu.ru
• Т-Ветвь (тимидил псевдоуридиловая). kpfu.ru Содержит псевдоуридин и обеспечивает взаимодействие тРНК с рибосомой. kpfu.ru
• Д-Ветвь (дигидроуридиловая). kpfu.ru Содержит дигидроуридин и обеспечивает взаимодействие тРНК с соответствующей аминоацил-тРНК-синтетазой. kpfu.ru

В трёхмерном пространстве молекула тРНК за счёт коаксиального наложения спиралей сложена в L-образную структуру, которая позволяет тРНК вписываться в P-сайт и A-сайт рибосом. ru.wikipedia.org