ПЦР с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР, RT-PCR) применяется, если в качестве искомого генетического материала выступает не ДНК, а РНК вируса. 3

Суть процесса: одноцепочечную молекулу РНК превращают в комплементарную ДНК (кДНК) с помощью особого фермента — обратной транскриптазы. 25 Так РНК превращается в ДНК-молекулу, готовую к дальнейшему копированию с помощью стандартной ПЦР. 3

Процесс состоит из двух этапов: 2

1. Реакция первой цепочки. 24 Комплементарная ДНК (cDNA) образуется на матрице мРНК из dNTP ферментом обратной транскриптазой. 24 Компоненты реакции смешиваются с ДНК-праймером и буфером с обратной транскриптазой на один час при 37 °C. 24
2. Реакция второй цепочки. 24 После того как обратная транскрипция закончена и образована cDNA на матрице мРНК, следующие циклы производятся по стандартной методике ПЦР. 24

ОТ-ПЦР используется для обнаружения молекул РНК в образце с заранее известным участком последовательности, комплементарным праймеру. 24