Механизм самоочищения водоёмов с помощью живых фильтраторов заключается в том, что эти организмы пропускают через себя воду и отфильтровывают взвешенные частицы. 15

Активные фильтраторы создают ток воды через специальные приспособления для фильтрации: жабры у двустворчатых моллюсков, ножки у усоногих и листоногих раков, ротовые придатки у веслоногих раков, жаберные тычинки у рыб, пластины китового уса у усатых китов и т. д.. 1

Пассивные фильтраторы расставляют свои ловчие сети в текучих водах так, что еда сама направляется к ним в «рот». 1

Например, у двустворчатых моллюсков мельчайшие животные и растения, а также органические остатки поступают в пищеварительную систему, а несъедобные вещества оседают на слое слизи, покрывающем поверхность мантии. 1 Слизь по мере загрязнения перемещается к концу раковины и выбрасывается в воду. 1

Далее самоочищение происходит за счёт разбавления и оседания частиц на дно, где токсичные вещества постепенно распадаются. 1