Механизм образования пептидных связей в живых клетках включает реакцию биохимического синтеза, называемую синтезом дегидратации или реакцией конденсации. 1

Процесс проходит в несколько этапов: 1

1. Выравнивание аминокислот. 1 Две аминокислоты выравниваются таким образом, что карбоксильная группа (COOH) одной аминокислоты и аминогруппа (NH2) другой аминокислоты находятся рядом друг с другом. 1
2. Образование водородной связи. 1 Водород (H) из аминогруппы и кислород (O) из карбоксильной группы образуют водородную связь, возникает временное притяжение между ними. 1

В живых организмах пептидная связь образуется либо в ходе биосинтеза белка на рибосомах, либо в ходе нерибосомального синтеза пептидов. 5 В любом случае энергия для процесса образования пептидной связи берётся из молекулы АТФ. 5

«Руководит» образованием пептидных связей между аминокислотными остатками сама рибосома, которая имеет два центра: аминоацильный (центр узнавания аминокислоты) и пептидильный (центр присоединения аминокислоты к пептидной цепочке). 3