Масс-спектрометрический анализ в промышленных лабораториях работает в три этапа: 2

1. Ионизация. 2 Молекулы анализируемого образца превращаются в заряженные частицы — ионы. 2 Процесс запускается и поддерживается разными способами, зависящими от типа вещества. 2
2. Анализ с сортировкой. 2 Ионизированные заряженные частицы поступают в анализатор, где создаётся электрическое либо магнитное поле. 2 В нём ионы сортируются, то есть разделяются по своим массам: самые лёгкие отклоняются интенсивнее по сравнению с более тяжёлыми. 2
3. Детекция. 2 Ионы на конечном этапе направляются в детектор, который осуществляет их регистрацию с определением количеств и масс частиц. 2

Алгоритм масс-спектрометрического анализа также включает введение изучаемой пробы в анализатор, выход ионов из области ионизации, получение частицами ускорения и их фокусировку для формирования пучка, сепарацию, то есть разделение пучка по массам ионов, и определение интенсивности всех выделенных компонентов пучка. 2

По полученному масс-спектру можно определить молекулярную массу, состав и структуру химических соединений, а также идентифицировать элементы в образцах. 1