Электрон-транспортная цепь (ЭТЦ) в процессе фотосинтеза работает следующим образом: 2

1. Электрон, покинув под действием энергии кванта света молекулу хлорофилла (Р680) в реакционном центре ФСII, передаётся через ряд переносчиков на пластохинон QA в белковом комплексе ФСII. 2
2. От пластохинона QA электрон переходит на липидорастворимые молекулы пластохинона (PQ), способные свободно передвигаться в липидном слое мембраны и переносить наряду с электронами и протоны. 2
3. Затем электроны поступают на железосерный белок FeSR и цитохром f, жёстко закреплённые в цитохромном комплексе b6-f. 2
4. От цитохрома f электроны переходят на Cu-содержащий белок пластоцианин (PC), восстанавливая его, а протоны выделяются в полость тилакоида. 2

В результате работы электронно-транспортной цепи происходит синтез восстановленного НАДФзН и запасается энергия в виде протонного градиента, которая затем расходуется на синтез АТФ. 2

Существует и циклический транспорт электронов. 2 В этом случае электроны от возбуждённых молекул Р700 последовательно переходят на переносчики А1, А2, АВ, Fd, затем на молекулы свободного PQ. 2 После этого электрон поступает на фиксированные в цитохромном комплексе переносчики цитохром b6, FeSR, цитохром f, пластоцианин (PC) и, наконец, на Р700, замыкая цепь. 2 При таком движении электронов НАДФ+ не восстанавливается, а освобождающаяся энергия идёт на процесс образования АТФ. 2 Такой транспорт электронов преобладает в стрессовых условиях для растения (засуха, высокая температура, инфицирование), когда необходимо срочное поступление энергии в виде АТФ. 2

Протоны, локализованные в люмене, создают электрохимический потенциал, который используется комплексом АТФ-синтазы для синтеза АТФ. 5