Спаривание антикодона тРНК с кодоном мРНК происходит в процессе синтеза белка на рибосоме по принципу комплементарности и антипараллельности. 3

Антикодон тРНК комплементарно присоединяется к кодону мРНК в ходе трансляции. 1 При этом антикодон комплементарен кодону, кодирующему ту аминокислоту, которую несёт эта тРНК. 1

Также существует гипотеза качания (wobble), предложенная Ф. Криком. 4 Согласно ей, 3′-основание кодона мРНК имеет нестрогое спаривание с 5′-основанием антикодона тРНК: например, У (мРНК) может взаимодействовать с А и Г (тРНК). 4