Репликация вирусных ДНК и РНК в поражённой клетке происходит по-разному в зависимости от типа генетического материала вируса. 4

У ДНК-геномных вирусов репликация вирусных ДНК принципиально сходна с репликацией клеточных ДНК. 4 Вирусная ДНК проникает в клеточное ядро, где протекает транскрипция — переписывание информации с ДНК на РНК с помощью клеточной ДНК-зависимой РНК-полимеразы. 2 В результате транскрипции на матрице одной из нитей ДНК синтезируется иРНК, которая перемещается в цитоплазму клетки и запускает процесс трансляции — перевода генетической информации с иРНК на последовательность аминокислот в вирусных белках. 2 Одновременно в ядре клетки протекает процесс репликации — образование дочерних нуклеиновых кислот на матрице материнской ДНК. 2 Синтезированные дочерние молекулы ДНК в составе нуклеокапсида перемещаются из ядра клетки в цитоплазму путём почкования, захватывая фрагмент ядерной мембраны. 2 В цитоплазме клетки завершается сборка дочерних вирионов и их выход из клетки. 2

Репликация плюс-РНК вирусов происходит непосредственно в цитоплазме клеток. 2 При этом функции иРНК выполняет сам геном. 2 Вирусная плюс-РНК высвобождается в цитоплазме, а затем транслируется рибосомами. 2 В результате этого образуется большая полипротеиновая молекула. 2 Клеточные протеазы «нарезают» образующийся вирусный полипротеин на структурные и неструктурные вирусные белки. 2 При этом образуется РНК-зависимая РНК-полимераза, которая способствует образованию минус-РНК на матрице родительской плюс-РНК. 2 На матрице минус-РНК происходит синтез молекул плюс-РНК, участвующих в биосинтезе белков дочерних вирионов. 2

Весь цикл репродукции у РНК-вирусов продолжается 4–8 часов, а у ДНК-вирусов — 12–24 часа. 2