Процесс видообразования на примере популяции рыб в озере Байкал происходит двумя путями: 1

1. Аллопатрическое (географическое) видообразование. 2 Происходит при географической изоляции между популяциями или вследствие резких отличий в окружающей среде внутри вида. 2 В результате в отделившейся популяции накапливаются изменения, что со временем приводит к дивергенции и формированию нового вида. 1
2. Симпатрическое (экологическое) видообразование. 2 Новый вид образуется внутри ареала исходного вида. 2 В основе этого процесса лежит экологическая изоляция, например, разобщение в сроках размножения внутри одного вида или сезонные изоляции у части популяции. 1 Это также приводит к накоплению изменений, вследствие чего возникает новый вид. 1

Например, на примере голомянок в озере Байкал исследования показывают, что дивергенция генетических групп и видов могла произойти из-за резких изменений климата в ледниковую стадию MIS4 45–75 тыс. лет назад. 4