Процесс отбора колоний бактерий с рекомбинантной плазмидой основан на использовании устойчивости штамма к антибиотику, которая кодируется маркерным геном на рекомбинантной плазмиде. 3

Процедура включает следующие этапы: 1

1. Клетки, трансформированные рекомбинантными молекулами ДНК, высевают на две чашки Петри с твёрдой питательной средой, каждая из которых содержит один из антибиотиков. 1
2. Бактериальные клетки выращивают в течение 12–24 часов. 1
3. Сравнивают результаты роста на обеих чашках и отбирают те клоны микроорганизмов, которые способны расти только на среде с одним из антибиотиков. 1

Ещё один способ отбора предполагает использование ультрафиолетового облучения. 1 Перед инкубацией микробные клетки подвергают этому воздействию, а клоны микроорганизмов отбирают с того места контроля, где клетки опыта погибли. 1

Для отбора целевых рекомбинантных клонов также применяют рестриктный анализ плазмидной ДНК или скрининг бактериальных колоний методом ПЦР. 5