Процесс образования диатомита в природных условиях происходит циклично из диатомового ила озёр, морей и океанов. 2 Он начинается с позднего мела. 2

Живые диатомеи были защищены панцирным скелетом, который образовывался на теле водорослей за счёт растворённых в морской воде солей кремния. 1 При смене времени года водоросли отмирали и опадали на дно моря. 4 Органическая часть их разлагалась, а панцири, состоящие из кремния, уплотнялись, и по прошествии миллионов лет образовали горную породу — диатомит. 4

Также в состав диатомита входят скелеты губок и радиолярий, между которыми оседали ил и глина. 5