Процесс фотосинтеза в морских водорослях происходит в хроматофорах — органеллах в клетке водоросли, аналогичных хлоропластам и осуществляющих фотосинтез. 3

Для улавливания света водоросли используют различные пигменты: хлорофиллы поглощают в основном синий и красный свет, каротиноиды — синий и зелёный свет, а фикобилипротеины — синий или красный свет. 2

Так как солнечный свет, проходя через толщу воды, рассеивается, что делает фотосинтез с увеличением глубины всё труднее, у многих групп глубоководных водорослей появились дополнительные пигменты, поглощающие лучи доступной синей области спектра. 5

Например, в красных водорослях для фотосинтеза на глубине используется пигмент фикоэритрин, который поглощает зелёные лучи спектра, подходящих на большую глубину. 1