Фосфодиэфирная связь образуется путём конденсации двух нуклеотидов. 4 В результате этой реакции между фосфатной группой одного нуклеотида и гидроксигруппой сахара другого возникает фосфодиэфирная связь. 4

При синтезе полинуклеотидной цепи эта реакция повторяется несколько миллионов раз. 4 Фосфодиэфирные мостики возникают за счёт прочных ковалентных связей, что сообщает всем полинуклеотидным цепям прочность и стабильность. 4

Некоторые процессы, в которых происходит образование фосфодиэфирных связей:

• Репликация ДНК. 2 При этом процессе образование фосфодиэфирных связей катализируется ферментом ДНК-полимеразой с использованием пары катионов магния и других вспомогательных структур. 2
• Репарация и рекомбинация нуклеиновых кислот. 2 В этих процессах образование связи может потребовать участия различных полимераз, праймеров и/или лигаз. 2

Задействованными сахаридными группами при образовании фосфодиэфирных связей являются дезоксирибоза в ДНК и рибоза в РНК. 2