Процесс обратной транскрипции у ретровирусов происходит так: вирусный фермент обратная транскриптаза (ревертаза) синтезирует одну нить ДНК на матрице вирусной РНК, а затем уже на матрице синтезированной нити ДНК достраивает вторую, комплементарную ей нить. 4

Некоторые этапы процесса:

1. Домен фермента обратной транскриптазы (РНКаза H) разрушает области U5 и R на 5'-конце РНК. 1
2. Праймер тРНК «перепрыгивает» на 3'-конец вирусного генома, и вновь синтезированные нити ДНК гибридизуются с комплементарной R-областью на РНК. 1
3. Большая часть вирусной РНК разлагается РНКазой Н, остаётся только последовательность PP. 1
4. Начинается синтез второй цепи ДНК с использованием оставшегося PP-фрагмента вирусной РНК в качестве праймера. 1
5. Праймер тРНК выходит, и происходит «скачок». 1 PBS из второй цепи гибридизуется с комплементарными PBS из первой цепи. 1
6. Обе нити удлиняются, образуя полную двухцепочечную ДНК-копию исходного генома вирусной РНК, которая затем может быть включена в геном хозяина с помощью фермента интегразы. 1

Обратная транскрипция происходит в цитоплазме, после чего вирусная ДНК переносится в ядро, где она интегрируется в хромосомную ДНК с образованием стабильного провируса. 2