Миграция кремния в водных экосистемах происходит следующим образом:

Основным источником кремния в природных водах являются процессы химического выветривания кремнистых минералов и растворение менее устойчивых пород, образованных останками диатомей, кремниевых губок, а также других тонкопористых пород. 1

В водных растворах кремнийсодержащие соединения могут находиться в растворённой, коллоидной и взвешенной формах. 3 Растворённая форма представлена в виде нейтральных молекул кремниевой кислоты H4SiO4 и/или её ионов H3SiO4– и H2SiO42–, соотношение между которыми определяется рН водной среды. 3 Ортокремниевые и олигокремниевые кислоты благодаря своей неустойчивости легко подвергаются конденсации с выделением воды и образованием поликремниевых кислот, что может приводить к образованию коллоидных растворов (гидрозолей). 1

Взвешенные формы кремния являются основными компонентами минерального вещества, которое седиментирует в водном объекте. 5 Количество взвешенных форм кремния в водоёмах и водотоках в среднем достигает 0,6 мгSi/л, и их содержание может превышать концентрацию растворённых форм. 5

Биологический круговорот кремния в природных водах обусловлен жизнедеятельностью диатомовых планктонных водорослей и последующим растворением их скелетов. 5 При разложении животных и растительных остатков он поступает обратно в водную среду. 5