Консолидация компонентов функциональной системы в онтогенезе происходит путём объединения отдельных фрагментов, развивающихся в различных частях организма. 5 Ведущую роль в этом процессе играет ЦНС. 5

Сначала объединяются те структурные части отдельных компонентов системы, которые уже созрели к моменту консолидации. 1 Благодаря этому функциональная система становится уже в какой-то степени продуктивной задолго до того, как все её звенья получат окончательное структурное оформление. 1

Например, сердце, сосуды, дыхательный аппарат, кровь объединяются в функциональную систему поддержания постоянства газового состава внутренней среды на основе совершенствования связей между различными отделами ЦНС, а также на основе развития иннервационных связей между ЦНС и соответствующими периферическими структурами. 5