Эволюция кишечной палочки в современных условиях происходит через процесс видообразования, который можно наблюдать в лабораторных условиях в долгосрочном эксперименте, начатом Ричардом Ленски в 1988 году. 13

В ходе эксперимента 12 исходно одинаковых популяций кишечной палочки Escherichia coli в течение более 60 000 поколений культивируются в одних и тех же условиях: в жидкой питательной среде, где единственным источником пищи является глюкоза. 3 Раз в сутки из каждой популяции берут небольшую часть и пересаживают в свежую питательную среду, где бактерии сначала быстро размножаются, а потом, по мере исчерпания глюкозы, рост численности замедляется. 3

Секвенирование ДНК бактерий из замороженной «ископаемой летописи» эксперимента показало, что за 60 000 поколений эволюция подопытных популяций не прекратилась и даже не замедлилась. 3 Как минимум в 9 популяциях из 12 произошла экологическая диверсификация: исходная монокультура подразделилась на клады, связанные экологическими взаимодействиями и не вытесняющие друг друга. 3 Внутри каждой клады эволюция продолжается полным ходом, причём дальнейшие изменения направляются как предшествующей эволюционной историей, так и меняющейся экологической обстановкой. 3