Дифференцировка клеток зародышевых листков в органы взрослого организма происходит, начиная со стадии гаструляции. 2 Клетки гаструлы начинают дифференцироваться, то есть становятся различными по биохимическому составу и структуре. 1

Некоторые процессы дифференцировки:

• Из эктодермы у позвоночных животных образуется нервная система, органы чувств, покровный эпителий с его железами и производными структурами (волосы, перья, копыта, когти и т. п.). 4
• Из энтодермы формируются органы пищеварительной и дыхательной системы: эпителий средней кишки, печень и поджелудочная железа, жабры, лёгкие, плавательный пузырь, а также щитовидная железа. 4
• Из мезодермы формируются все виды мышечной и соединительной ткани (например, дерма кожи, тела позвонков), кровеносная система, органы выделения, половые железы. 4

В основе дифференцировки лежит процесс постепенной дерепрессии генов исходно репрессированного генома зиготы. 2 Причём в разных частях зародыша дерепрессируются разные группы генов. 2