Денатурация ДНК (плавление) происходит при повышении температуры или добавлении щелочей. 1 В результате разрыва водородных связей между комплементарными основаниями нативная двухцепочечная ДНК переходит в одноцепочечную форму. 1

На денатурацию влияют несколько факторов, в том числе:

• Температура. 5 Температура плавления (Tm) — это температура, при которой денатурируется 50% всей ДНК. 1 Значение Tm зависит от последовательности ДНК и наличия конкретных химических модификаций. 5
• pH. 5 Как правило, денатурация ДНК происходит наиболее эффективно при незначительных базовых значениях pH (около pH 9). 5 В кислых или щелочных условиях структура водородных связей в молекуле ДНК может нарушаться, что влияет на эффективность денатурации. 5

Ренатурация ДНК (отжиг) происходит при охлаждении или понижении pH среды. 1 В результате восстановления двойной спирали ДНК. 1

Если температура или pH понижаются постепенно, то цепи соединяются правильно, с восстановлением всех исходных пар оснований. 1 При резком понижении температуры или pH правильное воссоединение комплементарных цепей затрудняется, и они остаются в несвязанном состоянии. 1