Развитие хоан у древних позвоночных происходило следующим образом: 14

1. У кистепёрых и двоякодышащих рыб во время зародышевого развития от обонятельных ямок отходят желобки, превращающиеся в каналы, внутренние отверстия которых, называемые первичными хоанами, открываются в ротовую полость. 13 При воздушном дыхании у двоякодышащих рыб ток воздуха проходит к лёгким по этим каналам. 1
2. У наземных позвоночных во время зародышевого развития также образуется носоротовой канал, соединяющий наружные носовые отверстия (ноздри) с ротовой полостью, куда он открывается первичными хоанами. 13 У земноводных такое положение хоаны остаётся в течение месяца. 1
3. У некоторых пресмыкающихся и птиц, а также у млекопитающих в связи с развитием вторичного твёрдого нёба верхняя часть ротовой полости, куда открываются первичные хоаны, отделяется от нижней части, образуя носоглоточный ход, который открывается в полость глотки вторичными хоанами. 13
4. По мере удлинения нижнего твёрдого нёба у млекопитающих, в том числе человека, вторичные хоаны оказываются отодвинутыми далеко назад к глотке. 13 Образование носоглоточного хода, отделённого от нижней части ротовой полости, и отодвигание хоаны ближе к гортани позволяет животным и человеку свободно дышать в то время, когда в ротовой полости находится пища. 13