Развитие эктодермы в эволюции живых организмов происходило следующим образом:

1. Формирование эктодермы происходит вскоре после оплодотворения, после чего начинается быстрое деление клеток. 4
2. Из эктодермы формируются покровы тела и чувствительные клетки. 2 У губок и кишечнополостных из этих слоёв формируются все специализированные клетки тела. 1
3. У более сложно организованных животных в ходе эмбрионального развития возникает и третий зародышевый листок — мезодерма. 2 Она формируется из энтодермы и всегда расположена между экто- и энтодермой в первичной полости тела. 3
4. Из эктодермы у позвоночных животных образуется нервная система, органы чувств, покровный эпителий с его железами и производными структурами (волосы, перья, копыта, когти и т. п.). 3