Эволюционное развитие архегониев у разных групп растений происходило следующим образом:

• У мохообразных архегоний развивается из единственной исходной клетки, которая подвергается серии делений для формирования брюшка и шейки. 1 Для оплодотворения необходима вода, поскольку сперматозоидам необходимо плавать, чтобы добраться до яйцеклетки внутри архегония. 1
• У птеридофитов (папоротников) архегоний также развивается из единственной начальной клетки гаметофита, которая подвергается серии делений с образованием брюшка и шейки. 1 После оплодотворения зигота остаётся внутри архегония и развивается в спорофит. 1
• У голосеменных растений архегонии расположены на женском гаметофите, который развивается внутри семяпочки. 1 Обычно они имеют форму колбы, с выпуклым основанием (вентерем), содержащим яйцеклетку, и каналом шейки, который облегчает проникновение сперматозоида для оплодотворения. 1

В процессе эволюции высших растений архегонии претерпевают упрощение (редукцию). 3 У наиболее высокоорганизованных покрытосеменных растений, а также у некоторых голосеменных растений (Welwitscia, Gnetuni) архегонии отсутствуют. 3