Некоторые различия процессов экспрессии генов у прокариот и эукариот:

• У прокариот процессы транскрипции и трансляции сопряжены: в процессе транскрипции образуется зрелая мРНК, которая сразу же может быть использована для трансляции. 4 Поэтому регуляция экспрессии осуществляется почти исключительно на уровне ДНК. 2
• У эукариот процессы транскрипции и трансляции пространственно разделены — они происходят в ядре и цитозоле соответственно. 5 Сначала происходит транскрипция и созревание в ядре, а затем трансляция в рибосомах цитоплазмы. 1
• У эукариот структурные гены, ответственные за разные звенья цепи биохимических реакций, как правило, разбросаны по геному, а не сосредоточены в одном опероне, как это часто имеет место у прокариотов. 1
• У эукариот существует одновременное групповое подавление активности генов во всём ядре, в целой хромосоме, или в большом её участке. 1
• У эукариот превалируют положительные регуляторные механизмы над отрицательными. 1