Правильно подобранные праймеры обеспечивают специфичность и чувствительность тест-системы, что важно для точности генетических исследований. 12
Некоторые аспекты влияния праймеров на точность:
- Специфичность. 2 При недостаточной специфичности праймеров в процессе ПЦР образуются продукты, которые могут быть идентифицированы как ложноположительный результат. 2 Кроме того, на процессы их накопления расходуются компоненты реакционной смеси, что приводит к потере чувствительности реакции. 2
- Отсутствие димеров и петель. 25 Если праймеры образуют устойчивые двойные цепи, это может повлиять на точность исследования. 2
- Расположение области отжига. 2 Она должна находиться вне зон мутаций, делеций или инсерций. 2 Если праймеры попадают в такую зону, не происходит отжиг, и возникает ложноотрицательный результат. 2
Для повышения точности используют два набора праймеров: первый — для амплификации более длинного фрагмента, второй — для амплификации внутреннего участка этого фрагмента. 4 Несколько раундов ПЦР проводят с первым набором, а затем добавляют второй. 4