Популяционная генетика помогает изучать генетические различия между различными группами людей следующим образом:

• Опирается на частоту определённого набора аллелей или мутаций в той или иной популяционной выборке. 1 Это позволяет более точно сгруппировать популяции и вычислить генетическое расстояние, то есть степень отличия частоты и набора аллелей одной популяции от другой. 1
• Прослеживает генетическую историю человеческих популяций. 3 Для этого наблюдают за изменениями в генах Y-хромосомы и ДНК митохондрий. 3
• Даёт возможность предположить об этническом происхождении человека. 3 Одни и те же полиморфизмы встречаются в разных популяциях с разной частотой. 3 Если встречается набор подряд идущих полиморфизмов, более характерных для некоторой популяции, то это аргумент в пользу того, что данный фрагмент генома был унаследован из этой популяции и, следовательно, именно к ней принадлежали предки человека. 3